太平天國失敗以後，各地反清之民變仍此起彼伏，其中較著名的有北方的捻軍、貴州的苗民起事、雲南及陝甘的回民起事等。

捻軍由農民、游民、散兵等組成，原來活動於皖北、蘇北、豫東南、魯西南一帶。太平天國運動爆發後，各路捻軍亦起而響應，在1855年(咸豐五年)會集於安徽蒙城，推張樂行(?一1863)為大漢明命王。天京陷落後，張樂行族姪張宗禹與任化邦(?一1867)率捻軍同太平天國遵王賴文光(1827一1868)所部會合，共同繼續反清之鬥爭。1865年(同治四年)5月，賴文光率捻軍在山東大敗僧格林沁統帶之清軍主力。次年，捻軍在與湘軍作戰中又獲大捷。此後捻軍分為東西二部，東路由賴文光、任化邦等率領轉戰於河南、江北間，西路由張宗禹率領入陝。但到1868年(同治七年)，東西二路捻軍均先後被清軍所消滅。

除捻軍之外，苗民、回民的起事，也是十九世紀五、六十年代反清民變的重要組成部分。貴州苗族張秀眉(?一1872)領導的反清鬥爭，自1855年(咸豐五年)至1872年(同治十一年)，前後堅持了十八載之久。雲南回民起義爆發於1856年，主要領導人是杜文秀(1823一1872)，它持續的時間也長達十七、八年。陝西、甘肅回民起事之時間稍晚，但與捻軍之鬥爭相互呼應，對清廷之統治亦威脅甚大。

到了十九世紀末，又有義和團運動。義和團原名義和拳，活動於山東、直隸一帶。最初它以「反清復明」為口號。到處設廠練拳，自稱持符唸咒即可「刀槍不入」、「槍炮不傷」。拳民在山東大拆洋教堂，殺逐教士，並屢屢打敗前來鎮壓之清軍。時山東巡撫毓賢(?一1901)因鎮壓無效，遂改剿為撫，承認義和拳為民間團練，力圖加以控制。於是義和拳便改名義和團﹐並且變口號作「扶清滅洋」。1899年(光緒二十五年)12月，清廷在列強壓力下，撤換毓賢，改派袁世凱為山東巡撫，對義和團重加鎮壓。1900年(光緒二十六年)春，部分義和團眾在張德成、曹福田率領下，移至直隸繼續活動。義和團的勢力很快地席捲直隸各地，大肆展開了排外活動。1900年4月，義和團進入天津，聲勢至為浩大。西太后攝於義和團之勢，便加以「撫用」，允許其進入京師，想利用它來對付列強。於是義和團遂得與「八國聯軍」在京津一帶直接對仗。在八國聯軍進攻京、津時，義和團首當其衝，犧牲不小。後清廷皇室見大勢已去，於是逃往西安，在逃亡途中西太后為討好洋人，反過來下諭各地官府痛剿義和團。在中、外敵手的聯合鎮壓之下，義和團運動遂告失敗。

太平天國與義和團均為清代後期重大之民變，然二者在鬥爭目標、組織基礎、運動規模、失敗原因諸方面，不盡相同，茲就其異同點比較說明如下:
     (一)鬥爭目標:太平天國與義和團主要鬥爭目標不同，前者乃針對滿清政府，有類歷代之農民戰爭，後者提出「扶清滅洋」，主要反對外國列強。但二者在整個鬥爭中所面對之敵人亦有相同之處，太平天國後期曾直接與外國人所組織的「常勝軍」作戰，帶有局部的反對外國侵略之性質;義和團最初係以「反清復明」為號召，後來雖被朝廷利用﹐但清室處心積慮地要除滅之，故彼此仍有相互鬥爭的一面。
     (二)組織基礎:二者主要參加者均為下層民眾，但太平天國發動的主要是南方之農民，義和團成員則為北方平民;太平天國自始至終都有統一的領導與指揮，組織十分嚴密，義和團則呈組織喚散、各自為戰之狀態，缺乏統一的指揮和領袖;二者均帶有宗教之色彩，太平天國藉基督教義進行鼓動，創「拜上帝會」，義和團原為白蓮教之一支，後仍以降神附體、持符捻咒來籠絡團眾。
     (三)運動規模:太平天國席捲之範圍遍及全國十八省，自金田起義至天京陷落前後堅持了十五年，其間提出過《天朝田畝制度》等重要的綱領並部分付諸實踐，建立強大之政權，並與清廷作長期的對峙;義和團之規模則遠遜於前者，其主要活動範圍在山東、直隸二省，前後鬥爭不過兩年．既無重大綱領亦未建立過政權。
     (四)失敗原因:太平天國失敗的一個主要原因，在於其反清宏圖未盡展即滿足於裂土稱王，並迅速出現領導集團之爭權內鬨，最後遂為中外敵人聯合鎮壓，而主要敗於湘、淮二軍之手;義和團主要敗於八國聯軍之手，但被清廷利用乃至出賣亦是其失敗的重要原因。

陳佳榮“南溟網”(http://www.world10k.com)_教學研究_
《中國歷代之興治亂衰亂亡》第廿四章_近代之憂患